Hệ thống giao dịch TPDN riêng lẻ cho phép thành viên giao dịch kết nối và gửi lệnh lên hệ thống giao dịch của HNX.
Hệ thống hiện hỗ trợ 2 loại lệnh là thỏa thuận điện tử và thỏa thuận thông thường (báo cáo giao dịch). Đối với lệnh điện tử, thành viên có thể lựa chọn gửi lệnh chào đến một số thành viên nhất định hoặc gửi lệnh đến tất cả các thành viên của thị trường và chỉ các thành viên nhận được lệnh chào mới có thể xác nhận lệnh.
Hệ thống cho phép trao đổi thông tin giao dịch, thông tin lưu ký với hệ thống của VSD.
Việc thanh toán các giao dịch TPDN riêng lẻ được thực hiện theo phương thức thanh toán tức thời theo từng giao dịch, tương tự phương thức thanh toán đang áp dụng trên thị trường chứng khoán phái sinh, hoặc lệnh sẽ được thanh toán vào cuối ngày giao dịch theo lựa chọn của nhà đầu tư.
Việc giao dịch TPDN riêng lẻ trên hệ thống được thực hiện thông qua thành viên giao dịch TPDN riêng lẻ (là các công ty chứng khoán).
Giao dịch TPDN riêng lẻ tương tự như cổ phiếu trên sàn HoSE hay HNX thay vì chỉ được thực hiện theo phương thức chuyển nhượng giữa các nhà đầu tư và tổ chức lưu ký trước đây.
