Dự án khu du lịch Tam Chúc được Thủ tướng chấp thuận chủ trương đầu tư tại Văn bản số 658/TTg-KTN ngày 11/5/2015. Đến thời điểm thanh tra, UBND tỉnh chưa phê duyệt quy hoạch chi tiết xây dựng để xác định cơ cấu sử dụng đất, xác định nghĩa vụ tài chính là không đúng với quy định tại khoản 3, Điều 108 Luật đất đai năm 2013 (UBND tỉnh đã giao một phần diện tích đất cho chủ đầu tư thực hiện dự án).
Thanh tra Chính phủ cũng xác định dự án khu du lịch Tam Chúc chưa có quy hoạch chung, quy hoạch phân khu, quy hoạch chi tiết theo quy hoạch tổng thể khu du lịch quốc gia đã được Thủ tướng phê duyệt năm 2018. Dự án này cũng được Thanh tra Chính phủ xác định là không có ý kiến thẩm định của Bộ Kế hoạch và Đầu tư về nguồn vốn và mức hỗ trợ từ ngân sách Trung ương.
Dự án còn có 3 tuyến đường thuộc giai đoạn 1 phê duyệt thiết kế bản vẽ thi công không phù hợp với thiết kế cơ sở được duyệt; có thiết kế cơ sở không lấy ý kiến thẩm định của bộ quản lý chuyên ngành theo thẩm quyền quy định với dự án nhóm A.
Ngoài ra, quá trình thực hiện, Sở Văn Hóa – Thể Thao – Du lịch tỉnh Hà Nam phê duyệt kế hoạch đấu thầu gói tư vấn khảo sát, lập dự án điều chỉnh bổ sung không đúng thẩm quyền; UBND tỉnh phê duyệt điều chỉnh hình thức hợp đồng từ trọn gói sang đơn giá điều chỉnh không đúng Nghị định 48/2010.
Thanh tra Chính phủ cũng cho rằng số tiền chi phí xây dựng trong dự toán phê duyệt của dự án không đúng, phải giảm trừ (tạm tính) hơn 446 tỉ đồng. Dự án này cũng có một gói thầu (tư vấn quản lý dự án) được UBND tỉnh phê duyệt hình thức chỉ định thầu không đúng, không thuộc trường hợp được chỉ định thầu.
Từ những vi phạm đã nêu, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo Chủ tịch UBND tỉnh Hà Nam chỉ đạo các cơ quan chức năng và chủ đầu tư dự án khu du lịch Tam Chúc khẩn trương hoàn thiện các thủ tục về đầu tư, xây dựng, đất đai..., giao đất, cho thuê, chuyển mục đích sử dụng đất, xác định tiền sử dụng đất, tiền thuê đất nộp ngân sách nhà nước.
Đối với dự án hạ tầng kỹ thuật khu du lịch Tam Chúc, Thanh tra Chính phủ kiến nghị cần phê duyệt quy hoạch chung, quy hoạch phân khu, quy hoạch chi tiết theo Quy hoạch tổng thể Khu du lịch quốc gia đã được Thủ tướng phê duyệt năm 2018; rà soát thiết kế các hạng mục công trình của dự án, đảm bảo theo đúng quy định.
Đối với hạng mục chỉnh trang lòng hồ Tam Chúc, phải thực hiện rà soát, thanh toán, quyết toán theo đúng quy định của pháp luật phần đã thực hiện; đầu tư bằng nguồn vốn xã hội hóa đối với phần chưa thực hiện (không thực hiện bằng nguồn vốn ngân sách nhà nước).
Ngoài ra, Thanh tra Chính phủ kiến nghị rà soát, giảm trừ thanh, quyết toán số tiền hơn 56,4 tỷ đồng của dự án đầu tư xây dựng công trình hạ tầng kỹ thuật khu du lịch Tam Chúc; rà soát, giảm trừ dự toán chi phí xây dựng với số tiền hơn 446 tỷ đồng của dự án này.